На территории России находится 103 заповедника. В соответствии с планом мероприятий по реализации «концепции развития системы особо охраняемых природных территорий федерального значения на период до 2020 года» в 2012—2020 годах планируется создать 11 новых заповедников. Согласно законам РФ заповедники являются одним из типов особо охраняемых природных территорий (ООПТ). Ниже представлен список государственных заповедников России.
Алханай Национальный парк Байкало-Ленский Заповедник Байкальский Заповедник Баргузинский Заповедник Витимский Заповедник Даурский Заповедник Джергинский Заповедник Забайкальский Национальный парк Заповедник Кузнецкий Алатау Прибайкальский Национальный парк Сохондинский Заповедник Тункинский Национальный парк Шорский Национальный парк
Биостанция Чистый лес Дарвинский Заповедник Калужские засеки Заповедник Лосиный остров Национальный парк Мещера Национальный парк Мещерский Национальный парк Окский Заповедник Орловское полесье Национальный парк Плещеево Озеро Национальный парк Приокско-Террасный Заповедник Смоленское Поозерье Национальный парк Угра Национальный парк Центрально-Лесной Заповедник
Алания Национальный парк Кабардино-Балкарский Высокогорный Заповедник Кавказский Заповедник Приэльбрусье Национальный парк Северо-Осетинский Заповедник Сочинский Национальный парк Тебердинский Заповедник Эрзи Заповедник
Большая Кокшага Заповедник Бузулукский бор Национальный парк Волжско-Камский Заповедник Жигулевский Заповедник Керженский Заповедник Марий Чодра Национальный парк Мордовский Заповедник Нечкинский Национальный парк Нижняя Кама Национальный парк Нургуш Заповедник Приволжская лесостепь Заповедник Присурский Заповедник Самарская Лука Национальный парк Смольный Национальный парк Хвалынский Национальный парк Чаваш Вармане Национальный парк
Валдайский Национальный парк Куршская коса Национальный парк Нижне-Свирский Заповедник Полистовский Заповедник Рдейский Заповедник Себежский Национальный парк
Басеги Заповедник Башкирия Национальный парк Башкирский Заповедник Висимский Заповедник Вишерский Заповедник Денежкин Камень Заповедник Зюраткуль Национальный парк Ильменский Заповедник Оренбургский Заповедник Печоро-Илычский Заповедник Припышминские боры Национальный парк Таганай Национальный парк Шульган-Таш Заповедник Югыд ва Национальный парк Южно-Уральский Заповедник